Typage bactérien

Informations générales

Examen

But de l'analyse	Cette analyse vise à déterminer le « sequence type » (ST) de pathogènes communs pour lesquels un schéma multi-locus sequence typing (MLST) est disponible. Exemple d’indication : - Surveillance épidémiologique - Placement d’une souche dans un contexte épidémiologique local, régional ou mondial en la comparant à des bases de données de référence de souches typées.
Indication diagnostique	Justifications cliniques demandées idéalement par contact téléphonique au 44107
Renseignement téléphonique	021 31 44 107
Horaire de réalisation	Heures ouvrables du laboratoire
Fréquence d'exécution	2x/mois
Analyse accréditée	OUI
Spécialité	Microbiologique Génomique
Synonyme	Typage, épidémiologie, phylogénétique

Prescription

Formulaire de demande

Numéro de commande 743200 Lien 151 - IMU - Examens microbiologiques

Pré analytique

Prélèvement

Nature	Souche bactérienne
Instruction(s) particulière(s)	Souche clonale d’une bactérie

Matériel standard

Quantité	1
Contenant	ESwab (bouchon rose Copan) N° commande : 935524
Contenant(s) autre(s)	

Stabilité maximale avant envoi

Réfrigéré

2 - 8 °C

Acheminement

Conditions d'acheminement Dans une pochette kangourou, séparer l'échantillon du bon de demande. Faire acheminer par porteur les échantillons précieux ou urgents

Dépose des prélèvements Réception des laboratoires Site BH18-100 Adresse Bugnon 46 1011 Lausanne Pneumatique 439 Horaire d'ouverture de la réception Lundi -> vendredi : 6h30 à 18h30 Samedi, dimanche et jours fériés : 6h30 à 14h00 Téléphone 021 31 44 280 Astreinte En dehors de ces heures, réception 24/24H  par le personnel de garde des laboratoires LCC-LCH Site web Réception des laboratoires

Analytique

Prestataire

Prestataire Laboratoire de génomique et métagénomique (microbiologie) Site BH18-100 Adresse Bugnon 46 1011 Lausanne Tube pneumatique 439 Horaire d'ouverture du laboratoire Lundi -> vendredi : 8h00 à 17h00 Téléphone 021 314 41 07 Site web Microbio génomique et métagénomique

Résultats

Délai de rendu

1-3 semaines

Méthode analytique

Principe de la méthode

Séquençage haut-débit (Whole genome)

Post analytique

Tarif

Tarif (CHF)

486